Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRDP23468 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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