Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL2P19875 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms