Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms