Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD4P09016 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms