Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms