Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP4O75161 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP4O75161 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms