Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNQ2O43526 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms