Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIAH2O43255 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms