Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
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CHD4Q14839 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
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CHD4Q14839 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHD4Q14839 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CHD4Q14839 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
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CHD4Q14839 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
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CHD4Q14839 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHD4Q14839 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHD4Q14839 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
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CHD4Q14839 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CHD4Q14839 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
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CHD4Q14839 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
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CHD4Q14839 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
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CHD4Q14839 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
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CHD4Q14839 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CHD4Q14839 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
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CHD4Q14839 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CHD4Q14839 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CHD4Q14839 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CHD4Q14839 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CHD4Q14839 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CHD4Q14839 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CHD4Q14839 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CHD4Q14839 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CHD4Q14839 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
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