Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CACNA1CQ13936 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
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