Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NEDD8Q15843 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
NEDD8Q15843 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-3.17□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.18□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
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NEDD8Q15843 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
NEDD8Q15843 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
NEDD8Q15843 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
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NEDD8Q15843 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
NEDD8Q15843 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
NEDD8Q15843 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
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