Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
GRIN2BQ13224 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.94□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
GRIN2BQ13224 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GRIN2BQ13224 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.06□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
GRIN2BQ13224 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GRIN2BQ13224 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GRIN2BQ13224 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
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