Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
PTPRJQ12913 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRJQ12913 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRJQ12913 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRJQ12913 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRJQ12913 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRJQ12913 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRJQ12913 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRJQ12913 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRJQ12913 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRJQ12913 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175 ms