Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-2.32□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TRNT1Q96Q11 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRNT1Q96Q11 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRNT1Q96Q11 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.6 ms