Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TRAM1Q15629 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TRAM1Q15629 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TRAM1Q15629 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRAM1Q15629 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TRAM1Q15629 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TRAM1Q15629 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.79□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TRAM1Q15629 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
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