Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
IFT88Q13099 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
IFT88Q13099 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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IFT88Q13099 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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IFT88Q13099 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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IFT88Q13099 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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IFT88Q13099 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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IFT88Q13099 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
IFT88Q13099 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
IFT88Q13099 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
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