Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.25□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SFTPCP11686 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-2.37□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SFTPCP11686 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SFTPCP11686 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.8 ms