Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GPA33Q99795 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
GPA33Q99795 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
GPA33Q99795 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.4 ms