Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
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ZIC1Q15915 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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ZIC1Q15915 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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ZIC1Q15915 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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