Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZIC1Q15915 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ZIC1Q15915 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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ZIC1Q15915 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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ZIC1Q15915 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ZIC1Q15915 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ZIC1Q15915 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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