Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
MRPL28Q13084 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
MRPL28Q13084 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.4 ms