Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
J3KRW8 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
J3KRW8 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
J3KRW8 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
J3KRW8 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
J3KRW8 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
J3KRW8 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
J3KRW8 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
J3KRW8 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
J3KRW8 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
J3KRW8 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
J3KRW8 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
J3KRW8 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
J3KRW8 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
J3KRW8 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
J3KRW8 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
J3KRW8 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
J3KRW8 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
J3KRW8 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
J3KRW8 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
J3KRW8 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
J3KRW8 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
J3KRW8 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
J3KRW8 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
J3KRW8 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
J3KRW8 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
J3KRW8 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
J3KRW8 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
J3KRW8 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
J3KRW8 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
J3KRW8 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
J3KRW8 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
J3KRW8 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
J3KRW8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
J3KRW8 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
J3KRW8 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
J3KRW8 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
J3KRW8 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
J3KRW8 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
J3KRW8 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
J3KRW8 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
J3KRW8 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
J3KRW8 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
J3KRW8 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
J3KRW8 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
J3KRW8 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
J3KRW8 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
J3KRW8 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
J3KRW8 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
J3KRW8 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
J3KRW8 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
J3KRW8 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
J3KRW8 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
J3KRW8 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
J3KRW8 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
J3KRW8 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
J3KRW8 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
J3KRW8 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
J3KRW8 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
J3KRW8 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
J3KRW8 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
J3KRW8 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
J3KRW8 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
J3KRW8 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
J3KRW8 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
J3KRW8 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
J3KRW8 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
J3KRW8 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
J3KRW8 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
J3KRW8 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
J3KRW8 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
J3KRW8 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
J3KRW8 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
J3KRW8 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
J3KRW8 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
J3KRW8 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
J3KRW8 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
J3KRW8 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
J3KRW8 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
J3KRW8 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
J3KRW8 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
J3KRW8 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
J3KRW8 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
J3KRW8 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
J3KRW8 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
J3KRW8 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
J3KRW8 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
J3KRW8 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
J3KRW8 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
J3KRW8 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
J3KRW8 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
J3KRW8 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
J3KRW8 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
J3KRW8 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
J3KRW8 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
J3KRW8 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
J3KRW8 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
J3KRW8 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
J3KRW8 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
J3KRW8 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.3 ms