Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP3Q9Y3E7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms