Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC5Q9UQL6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms