Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KDM5BQ9UGL1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms