Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms