Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms