Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HACD3Q9P035 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms