Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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HOXC10Q9NYD6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC10Q9NYD6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC10Q9NYD6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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