Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHBDL2Q9NX52 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms