Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ1

C8orf17, Protein MOST-1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf17Q9NRJ1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
C8orf17Q9NRJ1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms