Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFDQ9GZP0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms