Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SETD2Q9BYW2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SETD2Q9BYW2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms