Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms