Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGIP1Q9BQI5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SGIP1Q9BQI5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms