Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00969-272ENST00000626569 857 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMC1P3-201ENST00000453822 1318 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 YWHAZ-216ENST00000521309 1399 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 PQLC2L-203ENST00000449199 1484 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 CD226-207ENST00000582621 1458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 CWC15-201ENST00000279839 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4L1-201ENST00000315683 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 CABYR-201ENST00000327201 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 PCNAP3-201ENST00000397222 778 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 LDHAP7-201ENST00000398295 965 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121952.1-201ENST00000404382 547 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP65-201ENST00000410278 313 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 ZDHHC20P4-201ENST00000411421 1007 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 TMED5-204ENST00000479918 1296 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008066.1-201ENST00000520373 863 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7E47P-203ENST00000548970 984 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 PTTG4P-201ENST00000556391 352 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023983.1-201ENST00000579347 567 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103724.4-201ENST00000605981 292 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 SYTL2-228ENST00000533892 1441 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026725.1-201ENST00000511327 1588 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 SRSF10-214ENST00000492112 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 APOBEC2-201ENST00000244669 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02028-201ENST00000420947 528 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 TPTE2P1-202ENST00000429698 770 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP4-12Q9BQ66 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms