Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FGD4Q96M96 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGD4Q96M96 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD4Q96M96 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD4Q96M96 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms