Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HHIPL1Q96JK4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPL1Q96JK4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms