Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4CQ96DT6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms