Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCE1Q969G3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms