Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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