Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO2Q7Z6W1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms