Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms