Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXIP1Q6ZW49 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms