Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBR3Q6ZT12 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBR3Q6ZT12 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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