Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3HQ6NTF7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms