Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms