Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms