Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms