Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL24A1Q17RW2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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