Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FXNQ16595 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FXNQ16595 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FXNQ16595 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FXNQ16595 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FXNQ16595 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FXNQ16595 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FXNQ16595 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FXNQ16595 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FXNQ16595 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FXNQ16595 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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